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sars也被称为“sars”,2003年春天袭击了世界,据官方统计夺走了919人的生命。 亚洲地区疫情尤为严重,以中国内地、香港、台湾和新加坡、越南为中心。 这个“非典型肺炎”在人们心中留下了不可磨灭的“非典型记忆”……

“15年,果子狸没有被冤枉,而真正SARS病毒源头竟然是它!”

现在,《蝙蝠女侠》带领她的团队,找到了病毒的来源。 众所周知的哈克比辛也不是无辜的!

作者张18;

|秦珍子

15株蝙蝠sars样冠状病毒的基因序列新闻被输入生物新闻的解析软件,这些基因序列在某个地区近似,在某个地区不同。

开始运行软件,中国科学院武汉病毒研究所助理研究员胡犇一个人坐在实验室的电脑前等待。 几分钟后,一连串起伏不定的线出现在电脑屏幕上。

这些线意味着15株病毒中的几个病毒的基因组序列经过一系列的重新组合,与引发“非典型肺炎”流行的sars病毒,基因序列高度一致。

这15株病毒来自中国云南省的蝙蝠洞。

sars样冠状病毒的自然宿主菊头蝙蝠。 广东省生物资源应用研究所张礼标研究员供图

看到结果的瞬间,胡犇很平静。 他和研究小组对这些病毒进行基因组扩增,得到测序结果后,预测了现在的分析结果。 在随后的小组会议上,胡犇向研究小组组长石正丽报告了软件的分解结果。

“15年,果子狸没有被冤枉,而真正SARS病毒源头竟然是它!”

年11月30日,研究组在《公共科学图书馆-病原学》( plos pathogens )上在线发表了关于sars冠状病毒起源推理的论文。 12月1日,《自然》杂志的信息专栏报道了这篇论文。

“15年,果子狸没有被冤枉,而真正SARS病毒源头竟然是它!”

胡犇对中国青年报新闻网的记者说:“明确了非典冠状病毒可能的重组起源。”

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蝙蝠是sars样冠状病毒的自然宿主,断霉素也不是无辜的

15年过去了,胡犇2003年还是高三学生,武汉的夏天很热,但是人们出门的时候都记得戴着厚厚的口罩。

胡犇一边回忆,一边无奈地笑:“普通的口罩没有用,只是寻求心理上的安慰。”

即使在今天,“sars”这个词也让有经验的人吃惊。

在北京市卫计委公共处处长姚铁男的印象中,当时的sars病毒简直是“无影无踪”的存在。

2002年冬天悄然出现,2003年春天爆发,“传染性强、传播快、死亡率高”。 随着感染者的流动,蔓延到全国各地乃至世界各地,中国内地有24个省(区、市)报告了sars病例。

“15年,果子狸没有被冤枉,而真正SARS病毒源头竟然是它!”

历史上第一次,世界卫生组织发表了环球旅行的提案,让人们小心翼翼地出行。 该病命名为严重急性呼吸道综合征( severe acute respiratory syndrome ),简称sars。 疫情持续8个月,席卷26个国家,共有8096人感染,774人死亡。 其中,中国报告例7429例,死亡685例。 之后,sars几乎消失了,没有大的疫情发生。

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“一开始我不知道病原体是什么,”胡犇说。

实验室里科学家忙起来了。 很快,病毒从患者体内分离出来。 看起来像王冠,表面排列着多个规则的突起。 经过基因测序,研究人员发现这是“我们从未认识过的、全新的冠状病毒”。 从哪里来的? 哈比辛成为主要的“疑狱”。

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野味在大省广东,初期病例包括了解野味的厨师、野生动物市场商人等。 在非典流行之前,他们经常接触海狸。

研究人员说,很快从野生动物市场的哈克霉素中检测出了sars冠状病毒,“与人群中流行的sars病毒全基因组序列的一致性达到99.8%,两者高度相关。” 研究人员确认,哈克比星是将非典病毒传递给人类的直接来源。

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“但直接来源不是根本来源”胡犇向中国青年报新闻网记者解释说,要找到病毒的根本来源,最重要的是找到其自然宿主。

据胡犇称,病毒也是生物,目的不是杀死整个宿主,而是“生存”。 虽然有宿主可以长时间将某种病毒携带到体内,但不会因此而生病或死亡,而是与病毒和谐共处,在整个种群中,同种病毒存在一定的自然感染率。 这样的宿主在生物学上被称为自然宿主,像病毒的“蓄水池”。

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一系列动物实验表明,对于人类致命的sars冠状病毒,也能使哈克霉素生病。 另一方面,比较野生的新霉素和养殖的新霉素的大范围的流行病学调查结果也表明没有感染sars病毒。 哈比霉素只是中间宿主。

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2004年,中国科学院武汉病毒研究所研究员石正丽和当时在中国科学院动物所工作的张树义研究员,踏上了跟踪sars冠状病毒源头的旅程。 90年代,澳大利亚和东南亚发生了两种人兽共患的病毒感染,根源上来自同一种动物——蝙蝠。

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“一是从蝙蝠传给猪,然后传染给人。 另一个中间宿主是马。 这给跟踪sars病毒跟踪的研究小组提出了一种可能性,sars的来源不也是蝙蝠吗? ”。 胡犇说。

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对于研究病毒的学者来说,蝙蝠的地位是特殊的。

他们的学名是翼手,是哺乳动物中仅次于啮齿动物的第二大类群,其种类占哺乳动物种数的20%,广泛分布于全世界。 菊头蝙蝠是中国常见的蝙蝠种类之一,是食虫,平均寿命25年。

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蝙蝠也是埃博拉病毒、马尔堡病毒、狂犬病、亨德拉病毒、尼珀病毒等多种病毒的自然宿主。 由于蝙蝠有特殊的免疫系统,携带病毒很少见。 在漫长的进化过程中,蝙蝠成了数百种病毒的自然宿主。

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研究人员开始在蝙蝠的种群中跟踪sars冠状病毒。 石正丽和张树义研究员率领联合研究小组在广东、广西、湖北、天津等地采集了408只蝙蝠肛拭子、咽拭子和血样。

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实验室对这些样品进行了抗体和核酸检测。 他们在大蝙蝠种群中检测出了sars冠状病毒抗体。 在不同地区的大蝙蝠中检测出了“与遗传多样性的sars病毒相似的冠状病毒核酸”。 样本中也有蝙蝠冠状病毒。 根据全长基因组序列分析,能够感染人和断霉素的sars冠状病毒与基因组序列的相似度达到了92%。

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2005年,这个发现刊登在了《科学》杂志上。 他在论文中写道:“蝙蝠是sars冠状病毒相关冠状病毒的自然宿主,这些病毒被称为sars样冠状病毒,是引爆sars的病毒,也是这个冠状病毒家族的成员之一。”

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“哈克霉素是人类感染sars病毒的直接来源,作为中间宿主并不是无辜的。 事实表明,清除野生动物市场的断霉素对疫情起着抑制作用。 但是,要说根本的来源,作为自然宿主的蝙蝠可能性更高。 这篇论文是sars冠状病毒跟踪研究中的第一个里程碑。 ”。 胡犇说。

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最初的蝙蝠sars样冠状病毒的活病毒被分离出来了

确认蝙蝠是sars样冠状病毒的自然宿主,追踪的旅行才刚刚开始。

虽然基因组结构相似,但在重要的基因方面,研究小组当时发现的蝙蝠sars样冠状病毒与感染人和断霉素的sars病毒非常不同。 该关键基因也称为刺突蛋基因,也称为“s基因”。

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“冠状病毒的s蛋白负责病毒和细胞表面的受体结合,受体结合后病毒侵入细胞,确立感染。 病毒和受体的结合具有特异性,如果s基因不同,病毒的受体就可能不同。 这就像什么钥匙上有什么钥匙,如果找不到可以利用的受体,病毒就不能感染细胞。 所以,s基因是冠状病毒感染那些细胞,感染任何宿主,致病性无论如何都可以具有重要的决定作用”,胡犇说。

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蝙蝠sars样冠状病毒粒子中国科学院武汉病毒研究所供图

除了s基因之外,还有一些附属基因,并不完全一致。 这表明,先前发现的病毒与sars病毒的直接祖先有不小的差异,无法确认导致sars流行的病毒源头是蝙蝠。

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为了找到越来越多的证据,研究小组在中国西南、华南、华北、华中荒郊野岭继续研究征兵,并将西藏墨脱、云南西双版纳傣族自治州走得最远。 罗东升近两年刚进入抽样队,他想起有一天下午爬了几座山,挖了7个蝙蝠洞。 遇到洞口低矮的人,必须匍匐前进。

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蝙蝠洞在不远的山上,直线距离不过几十米,但走过去有时需要几个小时。 荆棘丛生,需要用刀或锄头开道。

越来越多的情况下,罗东升躺在汽车副驾驶座上,将望远镜对准窗外。 因为车在山路上行驶,所以他需要评价那些地方可能有蝙蝠洞。

作为课题组长,石正丽经常带队上山挖洞。 抽样工作一般为4人一组。 船员戴着n95口罩、手套、前灯,穿着防护服,傍晚在蝙蝠的开口处竖起了鸟网。 晚上,他们从捕鸟网中清除挂在网上的蝙蝠,在野外临时组装的工作人员台上,彻夜进行肛门擦拭采样。 他们抓住蝙蝠,用棉棒擦蝙蝠肛门取样本。

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抽出肛门擦子后,蝙蝠就会被释放。 “石老师始终坚持无侵害的采样,尽量不尸检,杀死蝙蝠,采样时也尽量减少对蝙蝠的身体伤害,”罗东升说。 蝙蝠种群数量少,破坏性采样很可能会对整个种群造成毁灭性打击。 蝙蝠在维持生态平衡方面发挥着重要意义,捕获大量蝙蝠,会给生态系统造成重大损失。

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尽管戴着手套,但被蝙蝠咬的风险依然存在。 研究组的范毅比画了蝙蝠的牙齿长度,但不久前,他的食指被蝙蝠咬了。

“在野外取样之前提前注射狂犬病疫苗。 蝙蝠携带的病毒中最危险的,”范毅说。

直到去年,在云南省的蝙蝠洞,研究小组终于找到了自己寻找的线索。

“从这个洞的样本中,首次检测到了更接近sars病毒的sars样冠状病毒s基因。 云南的这个洞比其他采样点更值得关注”从这一年开始,云南的这个蝙蝠洞被定为长时间的采样点。

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到去年10月为止,每年春秋两季,研究小组都会去那里。

研究小组在野外工作。 中国科学院武汉病毒研究所供图

胡犇解释说:“春天是蝙蝠繁殖的季节,秋天是冠状病毒检测阳性率最高的季节。”

这个洞穴的温度大约在22℃到25℃之间,湿度在85%到90%左右。 这里生活着很多菊头蝙蝠种群。 在整个云南,相似的蝙蝠洞其实并不少见。

黄昏时,研究小组在洞地上铺上布,收集第二天早上整晚采集的新鲜蝙蝠粪便。 每粒粪便样本约1克重,放入1毫升的收集溶液带回实验室,储存在零下80℃的冰箱中。 实验室提取了样品中的病毒rna。

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年,中国科学院武汉病毒研究所实验室从粪便样本中分离出首个蝙蝠非典样冠状病毒活病毒,命名为wiv1(wiv为武汉病毒研究所英语简称)。 它是一种比以往发现的蝙蝠sars样冠状病毒更接近sars冠状病毒的s基因,该蝙蝠sars样冠状病毒采用了与sars病毒相同的受体,能够感染人类细胞。 这一成果刊登在了去年11月的《自然》杂志上。

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第二个里程碑建成了。

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sars病毒起源问题,终于可以回答了

成功分离出了wiv1,全世界的科学家对sars病毒的起源,出现了分歧和争论“走向一致”。 持续了这么多年的追踪,目标渐渐明确——sars冠状病毒始于菊头蝙蝠。

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“但是,我们在云南这个采样点的蝙蝠中没有发现sars病毒最直接的祖先株。 也就是说,在所有基因中,我们都没有发现与sars病毒高度相似的蝙蝠病毒。 ”。 胡犇表示,当时整个证据链中,还有一条新闻鸿沟没有被填补。

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云南省蝙蝠洞的采样工作,连续5年采集10次,收集了64份蝙蝠粪便粒和肛拭子样本。 研究小组从这些样品中相继分离出3株活病毒,共计得到15株蝙蝠sars样冠状病毒的全长基因组序列。

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与引起sars流行的sars病毒相比,这15株病毒中s基因高度同源,各个附属基因不同,有些附属基因高度相似,但s基因有显著差异。

虽然没有一株病毒与sars病毒完全相同,但研究小组发现,这15株病毒中含有sars病毒的所有基因组成分。

“我们正在考虑一种可能性。 这个蝙蝠种群携带的不同病毒之间出现了基因改造,产生了sars病毒。 ”。 胡犇说。

年2月的一天,计算机开始推导15株蝙蝠sars样冠状病毒基因新闻的转基因。 最终证实了研究小组的推测。

研究小组正在进行样本解决。 中国科学院武汉病毒研究所供图

“云南的这个蝙蝠洞就像sars一样的冠状病毒基因库。 无论是s基因、附属基因还是非结构蛋白质基因,sars病毒的所有基因组成分都存在于这个天然基因库中。 ”。 胡犇对中国青年报新闻网记者说:“我们发现并进一步分解了这些蝙蝠sars样病毒基因组上的许多部位经常重组的证据,发现当时sars冠状病毒的直接祖先是这些蝙蝠sars样冠状病毒祖先株之间发生的一系列重组事件,

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对sars病毒的起源还存在疑问,终于可以回答了。

研究小组推测,sars冠状病毒的直接祖先株出现在云南和西南地区的某个蝙蝠种群中。 偶然,病毒感染了野生的断霉素,生病的断霉素被人类捕获了。 携带病毒的蝙蝠也有可能接触到了当地的断霉素养殖场。 当哈比辛到达广东野生动物市场时,病毒在其体内迅速进化,并以sars病毒的最终形态接触到人类。

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但是,一切只是推测,15年前的那个过程,并不是会被还原的。

“该发现提醒人们,减少蝙蝠等野生动物入侵栖息地,杜绝野生动物市场交易,对于防止新传染病的发生至关重要。 ”。 香港大学微生物学家袁国勇教授就这项研究发表了评论。

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“蝙蝠携带的非典样冠状病毒需要引起我们的重视,但也不必过度紧张。 只要我们与自然栖息地的蝙蝠保持一定的距离,病毒从蝙蝠中溢出的可能性就很小。”胡犇说:“另外,中间宿主,也就是与人类接触的机会增加的这些动物,在病毒从自然宿主到人类的这个传递链中起着重要的作用。 所以,不仅要和蝙蝠保持距离,还必须停止消耗断霉素等野生动物,将疾病暴发的风险降到最低。”

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胡犇将病毒监测和病毒发现事业称为“病毒研究的上游”,可以为“下游”的防治事业、诊断方法和疫苗研发以及其他基础研究奠定基础。 该研究意味着,像sars这样的新发冠状病毒病,仍有爆发的风险,为相关疾病的预防提供了依据。

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“这次发现的完美的sars样冠状病毒基因库,让疾控专家可以用软件事先模拟尚未出现、很可能出现的、可以感染人类的病毒,我们可以事先研究疫苗,研究对策。 》中国科学院院士、中国疾病预防控制中心主任高福对中国青年报新闻网记者说。

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他把sars疫情过后的中国疾控工作者称为“砂轮前进”,他说:“当mers (中东呼吸综合征冠状病毒)疫情发生时,我们很快就不再控制mers了,就像2003年一样。 ”。

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2003年5月9日,《中华人民共和国国务院令(第376号)——突发公共卫生事件应急条例》要求建立突发事件应急报告制度,“有可能发生传染病爆发、流行”和“发现不明原因的群体性疾病”等情况后,各级政府接到报告

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2005年,国家投入116亿元,建立以疾病防控机构为中心的疾病防控体系,作为处理突发公共卫生事件的应急体系。

“非典”后,北京市各级疾控部门开始对比突发公共卫生问题进行培训和演习。 北京市卫计委疾控部门建立了全天候连续运行的传染病监测互联网。 年,北京市投入1.75亿元,为市区二级疾控机构配备仪器装备。

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高福表示,一流的疾病控制,需要一流的科研成果作为支撑,体现在疾病控制的基础研究和应用研究中。

说到石正丽,他开了个玩笑。 “我们叫她bat woman,蝙蝠女侠。 ”。

参见----------------------------------------------------------------- -。

原标题:“蝙蝠女侠”队发现了sars病毒源头。”

原文刊登在中国青年报(年12月13日11版)上

标题:“15年,果子狸没有被冤枉,而真正SARS病毒源头竟然是它!”

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